荷葉木座三腳磁香爐，為本宮現存最古老之香爐，由信士邱大有敬謝。

一百多年前士林街信士組團前往福建泉州府南安縣，至廣澤尊王祖廟詩山鳳山寺迎請廣澤尊王聖像蒞宮鎮座，此香爐為陶瓷三腳香爐，應是為本宮郭聖王廣澤尊王第一只正式的香爐，由當時的弟子林俊德敬謝。

造型為圓形金屬香爐，左右兩旁香爐環為銜著鐵環的狻猊。本宮光復初期正殿仍可開放讓民眾進入參拜，此為註生娘娘之舊香爐，由信女高李笑敬奉。

為本宮現存歷史最久的匾額，為當時「內閣學士兼禮部侍郎提督福建全省學政｣孫詒經所敬題，提督學政職權為：掌管全省學校生員考課升降事，掌理歲、科二試，可見當時八芝蘭地區文風鼎盛，尚能向福建學政邀請提供其墨寶。

清光緒年間木雕聯對，書有「慈使眾而切瞻依洪惟我后、諴感神以通廣大克配彼天」，為本地潘光棇敬謝。

本宮「芝蘭宮」時期緣簽版，用以廟會或建廟時於祭祀圈內勸募時，張貼於各家門口以示該戶有參與募款。

在民俗藝術的分類屬宗教版畫之「神禡」，材質為鋅版。版畫中印有媽祖聖像，一旁有宮娥、千里眼和順風耳將軍。大符乃代表本宮聖母至信徒家中鎮宅平安，因此又稱「鎮宅符」。又對聯書有「處處田園大稔、家家老少均安」，由此可見媽祖信仰已跳脫航海神的信仰成為萬能之神，也反映當時士林本地為附近農產品販售集結之地。

在民俗藝術的分類屬宗教版畫之「神禡」，材質為鋅版。版畫中印有媽祖聖像，一旁有宮娥、千里眼和順風耳將軍。大符乃代表本宮聖母至信徒家中鎮宅平安，因此又稱「鎮宅符」。

廣澤尊王為重要的配祀神，日治初期本地人士前往祖廟鳳山寺迎請而來。故符首以「鳳山寺」為標題，該符版為民國三十六年丁亥八月二十二日，由本地人士高墀生寄附。

本宮廣澤尊王頗為靈驗，常被信徒請至家中供奉問事，迎請前必先向廟方登記，以免遺失神像。

本宮媽祖使用的籤詩為六十甲子籤，目前古籤版僅留「甲部」籤詩版，為清代監生魏闕所敬刊。

由士林街智勇里里民敬獻，因本宮採用六十甲子籤詩，包括籤王竹籤共有六十一隻，每隻竹籤都寫有「智勇里民一同 敬献」字樣。

本宮鎮殿媽祖神像早期所戴之鳳冠，為手工打造之銀帽。

為士林鎮全體里長贈與本宮，該花瓶飾以梅花，早期同為士林寺廟管理委員會之芝山巖惠濟宮，亦有保存了相同的花瓶。

本宮於昭和2年至12年與舊街神農宮一同進行改建，落成當時以大理石撰文刻碑，標題為〈士林慈諴宮神農宮兩廟改修誌」〉。
碑文為：維我臺灣孤懸海外 古曰神洲今為樂土 皇化覃敷 無遠弗屆 吾鄉壤接島都 夙稱八芝蘭 以舊街為中心點 生聚日繁 居民初業農 二百年來早建神農廟 威靈赫濯 厥後舟楫往返 頻涉重洋 商業殷賑 多祀天后藉庇航海安全 安政六年己未 先民卜地於下樹林 開拓新街稱霞樹林 後更美其名曰士林 而於街之當中劃為廟址 翌年庚申 居民喬遷 時有猴入樹林之謠 蓋深喜得時得地 預兆其必久必昌也 明治八年乙亥冬月 鳩工庀材建天后廟 星霜五易至庚辰歲告成 顏為慈諴宮 廟貌荘嚴 香火日盛 然因年湮代遠 風雨飄搖 丹青剝落 梁棟腐蝕 已失舊觀 於是群議改築 鄉黨翕然贊同 爰諏昭和二年小春之吉興工 改建兩廟 自是以還 匡直勞來 十載功成 輪奐盡美 採光通風 主重堅牢 冠冕堂皇 尤逾舊制 其所以致此之由 無非鄉中人士協力一致 不吝解囊 眾擎易舉 而董其事者 不惜勞瘁 擘畫周詳 加以廟有財物 並充經費 得睹今日落成之盛 猗與休哉 神人共感會見 秀毓芝蘭 祥徵霞樹 農報先疇 萬家皷腹 工爭居肆 百藝從心 市況繁榮 人文蔚起 福有修歸 報無或爽 爰謹識其梗概 以昭告來者昭和十二年歲次丁丑菊月重陽日公立